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據報載，簽訂兩岸租稅協定後，台商大陸企業股權移轉時，課稅權將交由台灣？！類似的論點之前報紙也曾刊載過；若為真，那真的是一項專屬的〝惠台政策〞（大陸稅務機關放棄課稅主權）。

新聞刊載，得免除在大陸繳納「境外股權移轉所得稅」的前提；
1.第三地公司實質管理處所（PEM）在台灣：（修正條文第43 條之4）營利事業之實際管理處所在我國境內者，應視為我國居住者，依本法規定課徵營利事業所得稅。
2.台商透過移轉第三地公司股權間接出售大陸公司股權，此部分未來將視為〝海外所得，稅率20%〞，還是併計大陸地區來源所得，個人最高稅率40%？雖然在台灣課稅可能適用的稅率較高，但是因為實務上大陸稅務機關在核定公允價格時，多以〝市值〞核定；未來台灣稅務機關若以股權移轉的價金核定，還是有可能省點稅；
3.經投審會申報核准之大陸地區投資案。

兩岸查稅 不溯既往

【經濟日報╱記者陳美珍／台北報導】2013.11.26 02:55 am

兩岸租稅協議三大歧見有解。據指出，我國已爭取對岸同意，將經由第三地投資大陸的台商納入雙邊協議，同時台商出售大陸股權的課稅權也由台灣取得；雙方並達成共識，課稅資料交換確定不溯及既往，台商過往投資可望不被查稅。

圖／經濟日報提供

台商投資大陸，有七成以上是透過間接投資，這些經由第三地投資大陸的台商，未來不必轉換身分，即可適用兩岸租稅協議的輕稅優惠。過去這些台商擔心，轉換投資身分出售大陸股權，恐面臨大陸依2008年頒布的59號文，按資產「公允價值」課以20%重稅，現在疑慮消除了。

財政部長張盛和昨（25）日傍晚拜會立法院院長王金平，尋求民意機構支持兩岸簽署全面性互免所得稅協議。張盛和表示，兩岸租稅協議的歧見已經全部解開，但是能否簽署仍要視立法院的態度，只有在國內具備高度共識之下，才會確定簽署協議。

張盛和表示，雙方已達成共識，間接投資台商只要經認定實質管理處所（PEM）在台灣，即使透過第三地赴中國大陸投資，即認定具有「台商身分」，也可以享有租稅協議的相關權益與保障。

張盛和也保證，兩岸租稅協議若能完成簽署，台商不必擔心投資資料全都露，也不必害怕政府利用租稅協議的交換機制對台商查稅。張盛和說，除非有明確且具體的逃漏稅事證，否則不會輕易交換課稅資料。

【2013/11/26 經濟日報】